Лаврский некрополь знаменит захоронениями семьи Бориса Годунова, князя Андрея Радонежского и представителей многих знатных русских фамилий. В храмах лавры покоятся московские архиереи, патриархи Алексий I и Пимен.
Троицкая духовная семинария готовила священнослужителей до 1814 г., а затем в лавре обосновалась Московская Духовная академия. К Троице-Сергиевой лавре относились еще и малые монастыри: скит Параклит, Черниговский скит, Гефсиманский скит, Боголюбская киновия, Троицкий Стефанов Махрищский монастырь и другие.
После событий Октябрьской революции (с 1917 по 1920 г.) были закрыты духовные школы, кощунственно вскрыты святые мощи преподобного Сергия Радонежского, закрыт Троицкий собор. До 1920 г. в скитах еще теплилась монашеская жизнь. Затем все оставшиеся монахи были выселены, а многие из них репрессированы. Все это вызвало многочисленные протесты верующих.
Согласно декрету Совета народных комиссаров в 1920 г. в стенах Троице-Сергиевой лавры был создан музей. Многие здания лавры были заняты научными учреждениями, а часть из них приспособили под жилье.
От сильных пожаров в июле и августе 1920 г. пострадали здания Пятницкой башни и Святых ворот Надвратной церкви Иоанна Предтечи. В октябре 1919 г. постановлением советских губернских властей был образован Сергиевский уезд, и посад получил статус города.
В 1930 г. город Сергиев был переименован в Загорск в честь одного из большевистских руководителей Москвы В. М. Загорского, погибшего после революции. В этом же году с колокольни были сброшены почти все колокола, в том числе и Царь-колокол, весивший 65 тонн.
Осенью 1941 г. в городе и его окрестностях проходило формирование 1-й Ударной армии, предназначавшейся для ведения наступательных боев. На протяжении всей Великой Отечественной войны на территории монастыря работали военные госпитали.