Главный храм Александро-Невской лавры – Свято-Троицкий собор, строительство которого началось в 1719 году по проекту архитектора Т. Швертфегера. Но потом он был разобран из-за трещин и перестроен по проекту И. Е. Старова. В 1782 году к собору была пристроена двухъярусная колокольня. Иконостас выполнен Л. Пинкетти, И. А. Акимовым и Я. Мейтерлейтеном. Собор расписан в 1806 году А. делла Джакомо по эскизам Дж. Кваренги, а в 1862 году заново П.С. Титовым по эскизам академика. Ф.Г. Солнцева.
Старейший храм обители – двухэтажная церковь в честь Благовещения Пресвятой Богородицы, построенная в 1717–1722 годах по проекту Д. Трезини. Нижний храм служил усыпальницей для особ царствующего дома (императора Петра III Феодоровича, Анны Леопольдовны, царицы Параскевы Феодоровны, царевича Петра Петровича, дочерей Александра I, великих княжон Марии и Елисаветы) и выдающихся государственных деятелей. Здесь похоронен А.В. Суворов. Благовещенскую церковь связывает с Троицким собором двухэтажный Духовский корпус, в котором была устроена церковь в честь Сошествия Святого Духа на апостолов с приделом преподобного Сергия Радонежского. До начала XX века храм был усыпальницей государственных и церковных деятелей.
Церковь святого благоверного князя Феодора Ярославича с 1806 года до начала XX века служила усыпальницей членов грузинских царских фамилий, скончавшихся в Санкт-Петербурге. С алтарной стороны Феодоровской церкви по проекту Г.И. Карпова в 1889 году была пристроена усыпальница митрополита Исидора (Никольского), освященная как придельная церковь во имя преподобного Исидора Пелусиота.
Церковь во имя Михаила Архангела построена в архиерейском доме в 1758 году по проекту М.Д. Расторгуева. В 1767 году в настоятельских покоях была освящена келейная церковь во имя Всех святых.
Крестовая церковь во имя Успения Пресвятой Богородицы заложена в 1861 году на третьем этаже архиерейского дома, левый придел освящен во имя святителя Тихона Задонского. Двухъярусный иконостас – работы С.В. Постемского, роспись храма – П.С. Титова.
Домовая церковь в честь Покрова Пресвятой Богородицы освящена в 1896 году при расширении трапезной архиерейского дома архитектором Л.П. Андреевым.