Монастырь разрастался и строился, несмотря на пожары, землетрясения и набеги завоевателей, грабежи и разбои. Матерь Божия веками хранила Свою обитель от разорения.
В конце XVI века монастырем бузуспешно пытались овладеть униаты, но Лавра выстояла и возглавила борьбу против насильственного окатоличивания украинского народа.
В 1688 году монастырь первым из русских обителей получает имя лавры в качестве введенного в России высшего титула монастырей.
XVII – начало XVIII века – время самого интенсивного строительства в Лавре. После очередного пожара, уничтожившего множество монастырских строений, деньги на восстановление Лавры дал Петр I.
Не перечислить всех имен, прославившихся в обители или прославивших ее своими трудами. Преподобный Петр Могила, преподобный иконописец Алипий, автор мозаик Успенского собора, преподобный врач Агапит, святитель Кирилл Туровский, летописец Нестор… В ее стенах молился и делал зарисовки богомольцев святитель Лука (Войно-Ясенецкий) – выдающийся врач и святой XX века. В период расцвета в Лавре действовали до 20 храмов.
Крупнейший книгоиздательский и просветительско-миссионерский центр, место паломничества тысяч и тысяч православных, место, которое Господь прославил множеством чудес и знамений…
В Лавре хранились собранные на протяжение ее многовековой истории бесценные святыни, замечательные древние произведения искусства, ценнейшая церковная утварь, богатейшее собрание рукописей и книг.
Ее здания отличались белокаменной резьбой, а порталы и иконостасы высокохудожественной деревянной резьбой. Она имела различные художественные мастерские. С 1616 года при Лавре работала первая в Киеве типография.
После Октябрьского переворота для Лавры снова, как в старину, начались страшные времена. В 1918 году в Лавре был убит митрополит Киевский Владимир (Богоявленский), первый новомученик-архиерей.
С 1926 года на территории Лавры действовал историко-архитектурный музей-заповедник, в его состав входили несколько узкоспециальных музеев.