С буржуазной революцией 1868 года, «воины-тени» навсегда исчезли с военной и политической арены.
Для самураев – благовоспитанных, элегантных и бескорыстных воинов – ниндзя, живущие где-то в затерянных лесах и горах, и ничего не знавшие, кроме хорошо оплачиваемого искусства, были чем-то вроде касты неприкасаемых. И, вместе с тем, эти бесстрашные и гордые воины никого так не боялись, как этих презираемых и отверженных «лесных демонов». Боязнь эта объяснялась тем, ни с чем не сравнимым мастерством, которым ниндзя владели в совершенстве и кроме которого, собственно, они больше ничего не умели делать.
Будущего ниндзя начинали воспитывать буквально с пеленок. Чтобы выработать способность группироваться при ударе и отталкиваться от стены, люльку с ребенком раскачивали так, чтобы она сильно ударялась о стену. Плавать и защищаться руками от ударов будущий ниндзя приучался раньше, чем ходить. Марафонский бег – в день по несколько десятков километров без остановки – был обычным для ребенка в возрасте 10-12 лет. В спринте нужно было бежать с такой скоростью, чтобы соломенная шляпа, прижатая к груди, не смогла упасть, придавленная потоком встречного воздуха. На трассе марафона ставили барьеры, капканы, ловушки, протягивали веревки и вырывали «волчьи ямы».
Дети обучались высшему классу верховой езды, прыгали в высоту через колючий кустарник или лезвия мечей, выполняли сложнейшие акробатические и гимнастические упражнения на высоко подвешенном тонком бревне или на веревке. Для того, чтобы передвигаться по территории противника, мало было уметь хорошо бегать – нужно было учиться ходьбе.