Следующим этапом был проект MKULTRANS», в результате которого отрабатывался вариант «зомби», действующий исключительно по приказу. Кроме проведения лабораторных и практических опытов на лицах, не осведомленных об этом, ЦРУ организовало учебные группы, включающие операторов детекторов лжи, специалистов по допросу и гипнотизеров, а также целый ряд других групп, все усилия которых были направлены на разработку надежных методов и средств управления психикой и соответствующих контрмер последним. В целом было определено 15 отдельных областей исследований.
Большинство программ по применению наркотиков выполнялось под руководством ВМС США. В госпитале ВМС в Бетесде работы по реализации такой программы начались еще в 1947 году под руководством доктора Гаевского и проводились вплоть до 1972 года. В отчетах ЦРУ данная программа характеризовалась как «попытка провести анализ и синтез возможностей чистых наркотиков с целью использования их в качестве средств воздействия на психику человека и управление ею».
Под руководством ВМС в университете штата Индиана осуществлялся проект под названием «Разоблачение лжи», возглавляемый доктором Эллсоном. Целью этого проекта было изучение психологических изменений, происходящих с человеком при даче им ложных сведений. Были разработаны механические и электрические устройства для определения этих изменений.
В университете Рочестер также под руководством ВМС доктор Уэнди проводил исследования, связанные с изучением возможностей двигательного аппарата. Как указывалось в отчете ЦРУ, данное исследование было направлено на определение «действия наркотиков на вестибулярные функции слухового аппарата и создание побочных эффектов, отражающих возможность воздействия на психику и управление ею».