Многое преподобный Иоанн провидел и предсказал относительно жизни и смерти (ответ 785 и 786) и вместе со старцем Варсонофием исцелил от болезни некоторого христолюбивого и страннолюбивого мужа (ответ 793). Также, по дару предвидения, избрал для рукоположения именно тех, которые были достойны сего (ответ 811). Ради же богатого дара пророчества, который дан был ему от Господа, он именовался от многих, как мы уже сказали, Иоанном Пророком. Посему-то и преподобный Никон на двух книгах, содержащих ответы сего отца, надписал: Иоанна Пророка.
Сей преподобный Иоанн предузнал и о своей кончине, о чем сказал: «В седминах аввы Серида я скончаюсь. Если бы авва Серид прожил долее, и я бы прожил еще пять лет, но как Бог скрыл его от меня и взял его, то и я не проживу более» (ответ 221).
Но так как авва Елиан, тогда еще юный по летам, будучи пострижен и поставлен во игумена обители, не зная уставов монастырских и как должно управлять братиею, умолял божественного Иоанна: «Хотя две недели подари мне, чтобы я мог вопросить тебя касательно монастыря и управления им», посему старец, сжалившись над ним и будучи подвигнут от живущего в нем Святого Духа, сказал: «Хорошо, я останусь с тобою еще на две недели». И авва Елиан спрашивал его о всем, касающемся до управления общежитием. По окончании же двух недель преподобный призвал всю монастырскую братию и, приветствовав каждого особо, отпустил их в свои келлии; и так предал в мире и безмолвии дух свой в руце Божии (ответ 221).
Когда же скончался преподобный Иоанн, то и святой Варсонофий умолк совершенно и более не давал никому ответов, как говорит авва Дорофей в заглавии второго своего Слова. А когда умолк Варсонофий, и самый сей авва Дорофей вышел из оной обители и составил свое (отдельное) общежитие.