В истории известны также периоды жёсткого противостояния светской власти и религии, когда в вопросах определения приоритетности влияния на социум между правителями и духовными лидерами возникали серьёзные конфликты, которые приводили то или иное государство к социальному или политическому кризису. В этом контексте очень показательна борьба религиозного духовенства за власть, освещённая историей католического папства, христианской Руси, исламских халифатов, султанатов.
Религия также стояла у истоков человеческой цивилизации и культуры, такие масштабные в культурном аспекте явления, как письменность, духовная, светская литература и поэзия, философия, архитектура и искусство самых различных жанров зачастую имеют прямое отношение к религии: они либо зародились в её недрах, либо религия способствовала их становлению и развитию.
Являясь по сути глубоко консервативным идеологическим продуктом, которому чужды все новации и изменения – особенно те, что реально угрожали её существованию или подвергали сомнению её догматы, религия всегда оставалась непримиримым оппонентом научных знаний и науки в целом. Например, в таких основополагающих вопросах, как происхождение всего живого на земле (природы), человека (процесс антропогенеза), роли социума в нашем мире, религия твёрдо придерживается только теологической (божественной) точки зрения, однозначно и безапелляционно отвергая все иные.
Тем самым научные достижения и концепции зачастую автоматически не признавались, а учёные почти всегда относились к категории «врагов», с которыми следует бороться.
К числу негативного влияния на современное общество нужно отнести и появление на религиозном горизонте бесчисленного количества сект, «пророков» и «святых», жаждущих заявить о себе как о «мессиях» и создателях новых конфессий.