По известным причинам на рубеже XX-XXI вв. НАН КР заметно сдала свои позиции и наше общество, которое всегда отличалось своей открытостью, не без основания критикует ее деятельность, полагая, что нет у нее серьезных достижений. Между тем, любой предвзятый член общества может убедится в том, что НАН КР сохраняет за собой в нашей стране пока непревзойденный научно-интеллектуальный потенциал в виде комплекса академических институтов, работающих в разных актуальных направлениях науки и технологий, а также в виде целой армии высококвалифицированных научных кадров, вносящих существенный вклад в научную сферу мирового порядка.
Выдающейся предприниматель Зафар Мирзо пишет: «В науке, бесспорно, есть законы, открытие которых зависело от способностей и усердий их открывателей и без которых, возможно, они еще относились бы к ее тайнам». Вот та задача, которая стоит перед фундаментальной наукой НАН КР, которая должна на наш взгляд постепенно превратиться из «Клуба ученых» в «Клуб научных идей, гипотез и открытий», то есть в фабрику по воспроизводству результативных достижений и ученых мирового уровня. Некогда Джулиана Вильсон писала: «Яблоко может послужить причиной открытия Закона всемирного тяготения, только если упадёт на подготовленную голову…».
В вышеуказанном смысле можно с гордость перечислить отдельные моменты высоких достижений и заслуг именно ученых академического сектора науки: 1) Все 6 зарегистрированных научных открытий кыргызских ученых в области фундаментальной науки сделаны в стенах НАН КР; 2) Ученые НАН КР традиционно лидируют в стране по массиву и качеству публикации результатов фундаментальных исследований в рейтинговых зарубежных изданиях; 3) НАН КР, как наиболее активное научно-инновационное учреждение в стране традиционно лидирует по количеству инновационных разработок, внедренных в производственный сектор; 4) В стране и за рубежом признаны научные школы НАН КР по различным отраслям и направлениям науки, а их представители в сравнительном аспекте достаточно хорошо представлены на пространствах мировой науки.