Декрет 1922 г. «Об изъятии церковных ценностей» позволил безнаказанно грабить накопленные веками церковные сокровища. Но не везде эти изъятия проходили гладко. В марте 1922 г. большевики встретили сопротивление верующих в Шуе. Произошедшие в этом ивановском городе события, стали поводом к началу новых гонений.
1920-е и особенно 1930-е гг. – самое тяжелое время для Русской Православной церкви. Арестовывались священники, и вслед за этим закрывались храмы, в которых они служили. Оставшиеся на свободе, вынуждены были часто менять приходы, упразднявшиеся под давлением властей. Бала утрачена последовательность в иерархическом управлении Русской Православной Церкви. После кончины Патриарха Тихона в 1925 г., согласно его завещанию, Патриаршим Местоблюстителем стал митрополит Крутицкий Петр (Полянский). Но с 1926 г. и вплоть до расстрела в 1937 г. митрополит Петр находился в заключениях и ссылках.
Фактически, обязанности Местоблюстителя легли на плечи митрополита Сергия (Страгородского), именовавшегося «Заместителем Патриаршего Местоблюстителя». Но в 1926 г. и он был арестован, тогда в права Местоблюстителя вступил архиепископ Ростовский Иосиф (Петровых). Когда власти арестовали и его, в управление Церковью должен был вступить архиепископ Екатеринбургский Корнилий (Соболев), но он находился в ссылке, и тогда, согласно распоряжению Иосифа (Петровых), обязанности церковного управления должны были быть возложены на архиепископа Астраханского Фаддея (Успенского), но тот к своему новому месту служения даже не доехал. В пути он был арестован в обязанности Заместителя местоблюстителя вступил Угличский архиепископ Серафим (Самойлович). В 1927 г., когда был освобожден из заключения митрополит Сергий (Страгородский), архиепископ Серафим (Самойлович) сложил свои полномочия Заместителя местоблюстителя. Митрополит Сергий нес нелегкое бремя управления Русской Православной Церковью вплоть до своей кончины. В 1943 г. он был избран Собором епископов в Патриархи Московские и всея Руси.