Он писал:
«Первое, что существенно в алхимии – это то, что ты должен практиковаться и проводить опыты, ибо кто этого не делает никогда не достигнет ни малейшей степени мастерства».
В своих экспериментах Гебер не просто взял за основу четыре абстрактных элемента-стихии Аристотеля, а провёл их тщательное лабораторное исследование и определил для каждого из них соответствующую группу конкретных химических веществ.
Исламский магистр был глубоко убеждён, что дар алхимического преобразования вещей, это великая милость Всеславного Творца, оказанная человеку-созидателю. Именно поэтому, одно из наиболее значительных своих произведений с описанием трансмутации металлов он назвал «Китаб ар-Рахма аль-Кабир» (Великая книга милосердия), которая сегодня храниться в Британском музее. Спустя полстолетия, другой великий исламский учёный-алхимик Абу Бакр ар-Рази напишет обстоятельный комментарий к этому произведению.
«Шейх алхимиков» разработал первую научную методику выполнения химических манипуляций и описал различные циклы лабораторных исследований, поэтому в последующей раннеевропейской традиции это называлось даже не «химией», а «работой Джабира». При этом в экспериментальных практиках, он широко использовал свою «теорию равновесия», в которой свёл все явления природы к определённым пропорциям и соотношениям. Скрытые свойства минеральных, растительных и животных элементов, были тщательно зашифрованы в отдельную книгу «Китаб аль-Хауаш аль-Кабир» (Великая книга об особых свойствах)
Исламский мейстер открыл хлорид серебра, «каустическую соду» (NaOH), азотную, соляную и серную кислоту, которая в те далёкие времена называлась «купоросным маслом». Он впервые создал мышьяк (затем этот лабораторный опыт повторил Альберт Великий) и впервые осуществил перегонку уксуса, выделив из него концентрат «уксусной кислоты», а затем из лимона и незрелых фруктов «лимонную кислоту». Мы находим в его работах первые методики опреснения воды, изготовления стальных лезвий, он предлагает химические формулу для изготовления женского макияжа, духов, а также много других инструкций по производству лабораторных устройств и всевозможных полезных веществ. «Шейх алхимиков» существенно модернизировал процессы испарения, сублимации, кристаллизации и прокаливания, впервые используя весы для точного взвешивания химических ингредиентов.